Можно ли организовать прохождение периодических медицинских осмотров работников в период междувахтового отдыха?

Можно, но только с согласия работников.

Справочно:

междувахтовый отдых – это дни отдыха в связи с переработкой рабочего времени в пределах графика работы на вахте.

 В период междувахтового отдыха работник свободен от исполнения трудовых обязанностей и использует это время по своему усмотрению. Поскольку прохождение периодического медицинского осмотра является обязанностью работника, соответственно работодатель должен организовать его прохождение в рабочее время. Если же прохождение периодических медицинских осмотров работников приходится на период междувахтового отдыха, то работодатель должен получить письменное согласие работников на прохождение медосмотра в этот период времени и предоставить работникам другое время отдыха.